Transcrição em Procariontes

     As características básicas da transcrição são as mesmas tanto em procariontes  quanto em eucariontes, mas muitos dos detalhes como as sequências promotoras são  diferentes. A RNA polimerase de E. coli foi estudada com mais detalhe. E nela existem  aproximadamente, 7.000 cópias de RNA polimerase, onde a maioria está relacionada à  síntese de RNA.

     Início das Cadeias de RNA: Envolve três etapas, que são:

     - Ligação de uma holoenzima RNA polimerase a uma região promotora no DNA;  Desenvolvimento localizado dos dois filamentos de DNA pela RNA polimerase, dando um  filamento molde livre para pareamento de bases com os ribonucleotídios que chegam;  Formação de ligações fosfodiéster entre os primeiros ribonucleotídios na cadeia de RNA  nascente.

     - Região Promotora: pequena seqüência de nucleotídeos reconhecida por uma RNA  polimerase como ponto onde deve se ligar ao DNA para iniciar a transcrição.

     - Promotores apresentam seqüências de consenso (sequências de nucleotídeos que  estão presentes em elementos genéticos conservados para serem reconhecidas) altamente conservadas que são reconhecidas pela enzima.

           Seqüências de consenso: 35: 5’-TTGACA-3’

                                                          10: 5’-TATAAT-3’

     Alongamento das Cadeias de RNA: Ocorre dentro da bolha de transcrição. A polimerase  continuamente desenrola o DNA a sua frente e enrola o DNA que está atrás do sítio de transcrição (já foi transcrito).

     A cadeia de RNA nascente vai se desligando do DNA à medida que a RNA  polimerase se move pela dupla hélice. A região de pareamento DNA-RNA é muito curta  (cerca de três pares de bases).

Figura 8: Separação local dos dois filamentos de DNA (regiões de genes). Um dos filamentos de DNA atua como molde. RNA polimerase adiciona ribonucleotídeos no sentido 5’-3’. Pareamento entre nucleotídeos complementares (pontes de H).

     Término: Ocorre quando a RNA polimerase encontra um sinal de término – o complexo  de  transcrição se dissocia e há liberação da molécula de RNA. Existem dois tipos de  terminadores em E. coli: Terminadores dependentes de rô (resulta no término da  transcrição apenas na presença da proteína chamada rô) Terminadores independentes de  rô (resulta no término da transcrição sem o desenvolvimento da proteína rô).

     · Os terminadores independentes de rô: apresentam seqüências nucleotídicas ( rica em  C:G seguida de seis ou mais pares de bases A:T, com os A presentes no filamento molde)  capazes de formar grampos (dificultam o movimento da RNA polimerase pela cadeia de  DNA). Os grampos são seguidos de uma seqüência rica em A (a ligação A-U é facilmente  rompida facilitando a liberação do RNA transcrito).

     · Os terminadores dependentes de rô: Esse mecanismo ainda é incerto. As sequências  de  terminação dependente de rô são de 50 a 90 pares de base de comprimento, e  especificam transcritos de RNA que são ricos em unidades C e sem unidades G. A proteína  rô se liga à cadeia crescente de RNA e se move de 5’ para 3’ ao longo da cadeia do RNA.  Quando a RNA polimerase diminui ou para na seqüência de terminação de rô, a rô se liga  à polimerase e retira o RNA da bolha de transcrição.